同一天,阿马斯雇佣军的飞机扫射了萨卡帕城的各个目标和萨卡帕桥。是日夜23时,危地马拉政府军在瓜兰城和雇佣军首次遭遇。雇佣军的阵地受到了政府军的攻击,雇佣军已在退却。
24日,危地马拉政府军俘虏了大批入侵的敌人,缴获了大批军用物资,包括机关枪和炸药等。
25日,阿本斯总统下令总攻,政府军曾一度将侵略军击溃,阿马斯逃入洪都拉斯境内。阿马斯立即电告美国中央情报局,要求派空军或海军陆战队支援。于是白宫决定给阿马斯飞机支援。同时决定由中央情报局特工戴维·菲利普斯加强“自由之声”秘密电台的宣传攻势,以便从心理上瓦解阿本斯政府军的斗志。
阿马斯有了空中支援,美国的战斗机在阿本斯总统府上空投弹、扫射,总统府火光冲天。“自由之声”秘密电台的策反和宣传攻势也奏效了,一部分政府军倒戈转向阿马斯。在里应外合的攻击下,阿本斯政府支撑不住了,28日,阿本斯总统在阿马斯上校逼迫下辞职。至此,危地马拉民族民主运动被扼杀了。阿马斯部队攻占总统府后,迅速建立了危地马拉新政府,自任国家元首。
这一军事政变遭到了国内外强烈反对,巴拿马的大学生在国民大学运动场上升起了危地马拉国旗,以示对危地马拉的侵略不终止,这面国旗就不会降落。